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br/> 无论是鲁鲁修还是CC，都是绝顶聪明之人，尤其是鲁鲁修，在一年前，他刚刚复活感觉到自己身体巨变的之时，就在思考这种变化的来源。
联系到那场灭绝人类的浩劫，以及在C世界的经历，鲁鲁修猜测，自己和CC的变化，肯定和被毁灭的人类有关。而现在，在来到陆地之后，他的这种预感，更加强烈了。
“去寻找吧！”
暂时还想不清楚的鲁鲁修，突然开口道，令正在操控那块巨石的CC稍微愣了一下，那块被当成玩具戏耍的巨石立刻轰然落地，重重的砸在地上，掀起一股尘埃。
“什么？”
“那些遗迹，还有人类毁灭的原因！”
鲁鲁修的目光在天空和大地之间来回打量着，目光越来越慎重。他似乎感觉到了一无比强大的意志，正从四面八方，天空和大地之间，窥视着自己，那里面，蕴含着一股强烈的恶意。
而空气中，同样也有一股不知名的声音，在呼唤着他，指引着他，似乎是想告诉他什么。
第二章 人类之王的救赎
世界上唯一剩下的一男一女两个人类，开始了探寻人类毁灭，和地球未来的旅途。在那股神秘的声音的指引下，鲁鲁修和CC的脚印踏遍了已经被毁灭的世界的每一个角落，将曾经查鲁鲁没有找到的遗迹，全部找了出来。
亚洲三座，欧洲三座，美洲三座，非洲一座，澳大利亚一座！
总共十一做遗迹神殿，十一扇通往C世界的大门。
但是，鲁鲁修和CC找到的时候，这些门，已经打不开了。即使结合他们两人CODE印记，加上那足以移山倒海的能力，也无法驱动这扇大门分毫。但是，鲁鲁修和CC并非一无所获，结合从十二座遗迹得到的信息，鲁鲁修推测，还有第十二座神殿，也是所有遗迹的中心。
它的位置，坐落在世界的中心，传说中的上古文明，亚特兰蒂斯文明淹没的太平洋底。
以非人之躯，达成奇迹的两人，花费了百年的世界，利用逐渐熟悉的力量，将整个太平洋中心的大海沟从中分开，终于发现了地十二座神殿。
亚特兰蒂斯文明，曾经的国都，也是最后一处遗迹！
踏入这座淹没在海底上万年的皇城，鲁鲁修和CC终于抵达了位于古城最中心的总神殿。在这里，鲁鲁修和CC终于从遗留在神殿里那铭刻在墙壁上的壁画，推知了发生在数万年前，亚特兰蒂斯文明，一夜之间消失的谜底。还有鲁鲁修和CC的CODE印记，以及GEASS，C世界，所有的一切，都在此刻，真相大白。
不错，无论是C世界，还是CODE，以及这些遗迹，都是数万年前，亚特兰蒂斯文明留下来的遗物。而直到这个时候，鲁鲁修和CC才最终得知了，人类战争，以及毁灭的真相。
毁灭人类的，并不是人类自己，而是……地球，所有生物的母亲，生命的起源！
她的名字，叫盖亚！
数百万年轻，毁灭横行地球两亿年的恐龙一族，然后又将极度发到的高等人类文明亚特兰蒂斯一举埋进太平洋的，正是地球的抑制力的象征，盖亚！
盖亚不光是抑制力，没错，因为在生命出现之前盖亚就存在。那时的它没有要抑制的对象，它的存在是在生命之后，为了保障生命中某一类的生存而出现的，存在的理由就是为了抑制所有能威胁灵长类全体存在的人、事、物所以它除了抑制力之外什么都不是。
数百万年前，恐龙一族膨胀到极限，已经威胁到了地球上所有的生命。所以，盖亚召来了一颗陨石，将所有的恐龙灭绝了。
第一次，盖亚慢慢拥有了自己的意识，也明白了自己的使命。
几万年前，灵长类的一只族群，三眼族人逐渐拥有了自己的文明，他们自称亚特兰蒂斯人，他们的文明，就叫做亚特兰蒂斯文明。亚特兰蒂斯人天生拥有强大的力量，能够行使精神力做到各种匪夷所思的事情。随着科技的发展，他们渐渐的将研究的对象转变到自己的身体。
身体的进化，精神的力量，以及最最神秘的灵魂。
这种行为，触犯到了生命的禁忌，引起了地球盖亚意识的注意。但是因为亚特兰蒂斯人的研究并没有威胁到其他生命的存在，而且也没有造成太大的破坏，所以盖亚意识只是在暗中监视着亚特兰蒂斯人的一举一动，并没有干涉他们的行为。