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当听到父皇亲口承认朝堂当中存在派别之争以后，太子的心更加骇然了。
“既然是派别之争，那……那为何父皇当时不制止呢？朝堂上不是最忌党争吗？若不防微杜渐，久而久之，大臣们分了党派互相时时攻讦，那怎生是好？”
“怎么？你想叫大臣们不要拉帮结派？”皇上有些讥讽地笑了笑，“大臣们按照各自的利益归属，本来就会各自抱团，形成自己的党派，你让他们不要私下来往，他们就不做了？自古堵不如疏，靠一味防堵就没有用的。再说了，文武大臣们如果不分党派，靠着皇帝一人，治得住吗？我是马上皇帝，我有威望，人人都不敢不听我的，我不怕，你呢？你上来了，制得住吗？”
皇上这一番诘问，让太子一时有些失语。
他之前没有想过这么深，此时细细一想，发现父皇说得可能还真是有些道理。如果文武大臣们全都结成一心，那皇帝的施政势必就会上下不畅，以至于被上下蒙蔽。另外，比之前明，新朝并没有建立像锦衣卫那样的特别机关，也没有庞大的内廷宦官群体作为辅助，相比人数庞大的外朝，实在应对起来有些吃力。
老师们从前明的教训出发，教导他要让大臣们万众一心，不要沉溺于党争耽误国事，而父皇却告诉他文武大臣们之间的争执非但不应该全部禁绝，反而应该默认，因为对皇家治国有利。
这互相矛盾又各有道理的话，让他脑子有些迷糊了，浑浑噩噩不知道该说什么好。
“迷糊了？”皇上看出了太子的状态，不过还是十分轻松，“迷糊了就好，治国哪里有那么容易啊，靠着老师说几句大道理就能治好国家，那天下哪里还有灭亡掉的朝代？有些事，不是用好或者不好就能说清楚的，要看具体情况，然后才能具体来办。你既然已经列席一次会议了，那以后也会继续列席的，好好学，该你学的东西还多得很！”
“那……那父皇，请问在你的心里，到底哪边的意见更有道理一些呢？”思考了一会儿之后，太子的脑子还是有些混乱，忍不住低声再问。“儿臣……儿臣列席的时候，听到两边的话都十分有道理，不知道该信那边的好……”
“道理？这世上满地都是道理，你是太子，我是皇上，大臣们无论对我们说什么，事前都会想好怎么讲道理的，而且都是冠冕堂皇的道理。你要事事讲道理，那正事还做不做了？”皇上拍了拍太子的脑袋，忍不住笑了出来，“所以，大臣们的意见和道理，你听着参考下就行了，做决定的时候你不用管他们说什么，他们说他们的，你做你的。你要的是治理天下，不是听大臣们怎么讲！”
接着，看着迷迷糊糊的太子，皇上继续说了下去，“不过，你真要说道理的话，还是内阁的话更有道理一些。你石叔叔他们有些蛮干了，话说得是好听，要分一分驻日使团的权，可是想要分权、想要把日本的金银矿攥在手里，好，但是首先你得要有人来管好啊？现在财计之才军中又哪里去找？真要按他们说的做那岂不是平添烦乱？”
“那……那父皇为何朝堂上不讲这些意见，反而不置可否，最后还提出那样的反感呢？”太子连忙问。
“朝堂上，我若是说一句，别人就会听成十句，而且元帅身份特殊，我今天在会上呵斥一句，明天朝堂上就到处都是流言了，那才叫添乱！再说了，大汉的体制才刚刚兴建不久，人的心多少还有一些旧日的影子，既然要拨乱反正让天下重拾尚武之风，那就尽量不能挫伤了从军之人的锐气，虽然有可能是矫枉过正，但是有些事不得不做。现在对军队尽量偏袒一点没关系，等过些年，文武同等的心思真的进了每个人的心思了，到时候再来什么不偏不倚，岂不更好？”
因为痛感大明文贵武贱以至于将领都不愿意为国效劳的教训，所以皇上特意在新朝实行了文武分离的制度，严令文臣不得领军，而且还有意用各种方式来提高军人的地位。奈何新朝建立时间太短，很多时候朝廷上下还是用前明的思路来处置问题，所以有意无意就会有损于军人的利益和地位。
虽然偏袒军人一边可能会有失公平，但是考虑到好不容易培养起军人的心气不能轻易打压下来，所以皇上一直都对军队十分优容，也杜绝了朝廷内外因为天下已经开始安定而想要限制军队人数和势力的想法。